Se ofrece a los interesados la oportunidad para hacer Doctorado en Biología en Proyecto de investigación/doctorado (mediante beca CONICET pura o cofinanciada)y sumarse de esta forma a lineas de trabajo en sistemática y biogeografia
Lugar de trabajo: Puerto Madryn
Tema:biodiversidad de micromamiferos y megamineria (oro, uranio, plata) en Patagonia central (arida) Se requiere buena aptitud física para el trabajo de campo, experiencia en conducciónde vehículos (normal) y aptitud para interacción.
Contacto: ulyses@cenpat.edu.ar
miércoles, 30 de junio de 2010
CURSO DE POSGRADO
USO DE TECNICAS MOLECULARES EN SISTEMATICA Y GENÉTICA DE POBLACIONES
Unidad Académica Organizadora: Cátedra de Genética de Poblaciones y Evolución y Doctorado en Ciencias Biológicas. Facultad de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales, Universidad Nacional de Córdoba.
Modalidad: Teórico-práctico
Duración: 45 hs. (40 presenciales, 5 no-presenciales).
Fecha de realización: 19 al 23 de julio de 2010.
Lugar: Facultad de Ciencias Exactas, Av. Vélez Sarsfield 299. Córdoba.
Destinatarios: alumnos del doctorado en Ciencias Biológicas, egresados de la carrera de Biología y carreras afines (Cs. Agropecuarias, Lic. en Genética, etc.)
Responsable académico y administrador de los fondos: C. N. Gardenal
Cupo: 12 alumnos
Arancel: $ 500. Alumnos inscriptos en el Doctorado en Ciencias Biológicas de la Universidad de Córdoba, $ 300.
Docentes participantes: Dres. Marina Chiappero, Beatriz García, Norma B. Julio, Raúl González Ittig y Paula Rivera.
OBJETIVOS
1. Conocer los principios, aplicaciones y limitaciones de las técnicas moleculares en Sistemática y en Genética de Poblaciones.
2. Conocer criterios que permitan seleccionar los marcadores más adecuados para resolver problemas taxonómicos a diferentes niveles (intra e inter-específico, a nivel de género y taxones superiores).
3. Recibir entrenamiento en la utilización de nuevas herramientas para el análisis de la biodiversidad, teniendo en cuenta la historia evolutiva de poblaciones y de especies.
4. Comprender el uso de diferentes programas de computación corrientemente utilizados para el análisis de datos.
PROGRAMA SINTÉTICO
1. Toma y conservación de muestras para la aplicación de diferentes técnicas.
2. Aislamiento de ADN.
3. Amplificación de segmentos de ADN mediante la reacción en cadena de la polimerasa (PCR). A) Amplificación con cebadores específicos (ADN mitocondrial y nuclear. Microsatélites.)
B) Utilización de cebadores arbitrarios (RAPDs, ISSR, AFLP).
4. Polimorfismo de longitud de fragmentos de restricción (RFLP) y secuenciamiento.
5. Métodos de análisis en la inferencia de la filogenia: uso de programas como Arlequin, PAUP, TNT, TFPGA, Mr. Bayes.
BIBLIOGRAFIA BASICA
1. Avise J C. 2004. Molecular markers, Natural History and Evolution. Chapman & Hall, New York.
2. De Salle, R., Giribert, G. y Wheeler, W. 2002. Techniques in Molecular Systematics and Evolution. Birkhäuser, Basilea.
3. Hillis D M, C. Moritz, B K Mable. 1996. Molecular Systematics. Sinauer Ass., Inc. Sunderland, Massachusetts.
4. Yang Z. 2006. Computational Molecular Evolution. Oxford Series in Ecology and Evolution, Oxford.
5. Ferraris J D, S R Palumbi. 1996. Molecular Zoology: advances, strategies and protocols. Wiley-Liss, New York.
6. Hoelzel, A R. 1992. Molecular Genetic Analysis of Populations. A practical approach. IRL Press. Oxford.
Trabajos en publicaciones periódicas empleados para Seminarios durante el curso: se actualizan anualmente.
Evaluación final: escrita, a cargo de C.N. Gardenal, N. Julio y M. Chiappero.
Informes e inscripciones:
njulio@efn.uncor.edu
ó : Cátedra de Genética de Poblaciones y Evolución, F.C.E.F.y N., Tel. (0351) 433 2098/2100, interno 234.
Enviar un breve CV y un párrafo sobre las motivaciones que lo llevan a realizar el curso.
Carrera de Doctorado en Ciencias Biológicas
Facultad de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales
Universidad Nacional de Córdoba
Av. Vélez Sarsfield 299 - 5000 Córdoba
Tel/fax 0054-351-4332131
doctbiol@com.uncor.edu
http://www.efn.uncor.edu/escuelas/4to/dcb/
Unidad Académica Organizadora: Cátedra de Genética de Poblaciones y Evolución y Doctorado en Ciencias Biológicas. Facultad de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales, Universidad Nacional de Córdoba.
Modalidad: Teórico-práctico
Duración: 45 hs. (40 presenciales, 5 no-presenciales).
Fecha de realización: 19 al 23 de julio de 2010.
Lugar: Facultad de Ciencias Exactas, Av. Vélez Sarsfield 299. Córdoba.
Destinatarios: alumnos del doctorado en Ciencias Biológicas, egresados de la carrera de Biología y carreras afines (Cs. Agropecuarias, Lic. en Genética, etc.)
Responsable académico y administrador de los fondos: C. N. Gardenal
Cupo: 12 alumnos
Arancel: $ 500. Alumnos inscriptos en el Doctorado en Ciencias Biológicas de la Universidad de Córdoba, $ 300.
Docentes participantes: Dres. Marina Chiappero, Beatriz García, Norma B. Julio, Raúl González Ittig y Paula Rivera.
OBJETIVOS
1. Conocer los principios, aplicaciones y limitaciones de las técnicas moleculares en Sistemática y en Genética de Poblaciones.
2. Conocer criterios que permitan seleccionar los marcadores más adecuados para resolver problemas taxonómicos a diferentes niveles (intra e inter-específico, a nivel de género y taxones superiores).
3. Recibir entrenamiento en la utilización de nuevas herramientas para el análisis de la biodiversidad, teniendo en cuenta la historia evolutiva de poblaciones y de especies.
4. Comprender el uso de diferentes programas de computación corrientemente utilizados para el análisis de datos.
PROGRAMA SINTÉTICO
1. Toma y conservación de muestras para la aplicación de diferentes técnicas.
2. Aislamiento de ADN.
3. Amplificación de segmentos de ADN mediante la reacción en cadena de la polimerasa (PCR). A) Amplificación con cebadores específicos (ADN mitocondrial y nuclear. Microsatélites.)
B) Utilización de cebadores arbitrarios (RAPDs, ISSR, AFLP).
4. Polimorfismo de longitud de fragmentos de restricción (RFLP) y secuenciamiento.
5. Métodos de análisis en la inferencia de la filogenia: uso de programas como Arlequin, PAUP, TNT, TFPGA, Mr. Bayes.
BIBLIOGRAFIA BASICA
1. Avise J C. 2004. Molecular markers, Natural History and Evolution. Chapman & Hall, New York.
2. De Salle, R., Giribert, G. y Wheeler, W. 2002. Techniques in Molecular Systematics and Evolution. Birkhäuser, Basilea.
3. Hillis D M, C. Moritz, B K Mable. 1996. Molecular Systematics. Sinauer Ass., Inc. Sunderland, Massachusetts.
4. Yang Z. 2006. Computational Molecular Evolution. Oxford Series in Ecology and Evolution, Oxford.
5. Ferraris J D, S R Palumbi. 1996. Molecular Zoology: advances, strategies and protocols. Wiley-Liss, New York.
6. Hoelzel, A R. 1992. Molecular Genetic Analysis of Populations. A practical approach. IRL Press. Oxford.
Trabajos en publicaciones periódicas empleados para Seminarios durante el curso: se actualizan anualmente.
Evaluación final: escrita, a cargo de C.N. Gardenal, N. Julio y M. Chiappero.
Informes e inscripciones:
njulio@efn.uncor.edu
ó : Cátedra de Genética de Poblaciones y Evolución, F.C.E.F.y N., Tel. (0351) 433 2098/2100, interno 234.
Enviar un breve CV y un párrafo sobre las motivaciones que lo llevan a realizar el curso.
Carrera de Doctorado en Ciencias Biológicas
Facultad de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales
Universidad Nacional de Córdoba
Av. Vélez Sarsfield 299 - 5000 Córdoba
Tel/fax 0054-351-4332131
doctbiol@com.uncor.edu
http://www.efn.uncor.edu/escuelas/4to/dcb/
CURSO DE POSGRADO
Introducción a la informática de la biodiversidad
26 de julio - 6 de agosto, 2010, 9 a 17hs.
Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, Universidad de Buenos Aires
Docente responsable: Martín Ramírez (investigador independiente, CONICET. Profesor adjunto, EGE FCEyN-UBA).
Profesor invitado: Renato Mazzanti (profesor adjunto, Universidad Nacional de la Patagonia).
Carga horaria: 60 horas
Modalidad: Teórico-práctico con examen final
Pre-Inscripción: Hasta el 15 de julio de 2010, enviar un e-mail a Martín Ramírez incluyendo:CV, cargo actual, lugar de trabajo y tema de estudio. Carta de intención explicando cómo piensa aplicar los conocimientos adquiridos en el curso.
Cupo máximo: 30 alumnos (prioridad: doctorandos UBA; de otras universidades con proyectos de tesis afines a los contenidos del curso)
Arancel: $80
Programa
Contenidos teóricos y metodológicos
Introducción general
Tipos de datos de biodiversidad: Taxonómicos, geográficos, ambientales, cronológicos, anatómicos, desarrollo, parentescos. Origen de datos de biodiversidad: Colecciones biológicas, observaciones, multimedia. Datos y metadatos. Especificaciones utilizadas en biodiversidad y disciplinas relacionadas.
Introducción a las bases de datos
Concepto de normalización e integridad eferencial. El modelo entidad-relación. Bases relacionales vs. bases orientadas a objetos, estado del arte. Las bases de datos heterogéneas distribuidas, su aplicación a la biodiversidad. Repositorios de datos.
Introducción a los metadatos
Datos y metadatos. Especificaciones utilizadas en biodiversidad y disciplinas relacionadas. Darwin Core: Versiones e implementaciones.
Metadatos de conjuntos de datos
Catálogos de metadatos de recursos de biodiversidad.
Metadatos de ubicación geoespacial
Método punto-radio. Protocolos de georreferenciación.
Metadatos de imágenes biológicas
Metadatos embebidos. Vistas estandarizadas. Repositorios. Digitalización de ejemplares mediante imágenes.
Datos taxonómicos
Catálogos de autoridad taxonómica. Agregadores de datos taxonómicos. Estimas de diversidad con taxonomía incompleta.
Identificadores únicos
Importancia y problemas de identificadores únicos. URIs, LSIDs.
Ontologías biológicas
Conceptos, relaciones y razonamientos automáticos. Web semántica, repositorios RDF.
Anotaciones utilizando ontologías.
Herramientas de adquisición de datos de colecciones biológicas
Funciones y problemática general. Modelos de datos usuales.
Proveedores de datos
Función y tecnología empleada. Proveedores TAPIR, IPT
Portales de datos
Función y tecnología empleada. Portales de iniciativas de biodiversidad.
Aplicaciones de datos de biodiversidad
Cybertaxonomía. Identificación taxonómica automática: DNA Barcodes y sistemas basados en imágenes. Modelado de distribuciones predictivas. Áreas de endemismo.
Inventarios y estimas de riqueza.
Trabajos prácticos
Búsquedas y procesamiento de datos de portales: GBIF, SNDB, BOLD, Morphbank.
Consultas en bases de datos relacionales.
Mapeo de campos de colecciones biológicas a Darwin Core.
Validación de colecciones de datos. Problemas
generales, métodos manuales y automáticos.
Georreferenciación de localidades geográficas.
Uso de servicios web.
Martin J. Ramirez
Profesor Adjunto UBA FCEyN EGE
Curador General & División Aracnología
Museo Argentino de Ciencias Naturales - CONICET
Av. Angel Gallardo 470
C1405DJR Buenos Aires
Argentina
tel +54 11 4982-8370 int. 169
fax +54 11 4982-6670 int. 172
26 de julio - 6 de agosto, 2010, 9 a 17hs.
Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, Universidad de Buenos Aires
Docente responsable: Martín Ramírez (investigador independiente, CONICET. Profesor adjunto, EGE FCEyN-UBA).
Profesor invitado: Renato Mazzanti (profesor adjunto, Universidad Nacional de la Patagonia).
Carga horaria: 60 horas
Modalidad: Teórico-práctico con examen final
Pre-Inscripción: Hasta el 15 de julio de 2010, enviar un e-mail a Martín Ramírez
Cupo máximo: 30 alumnos (prioridad: doctorandos UBA; de otras universidades con proyectos de tesis afines a los contenidos del curso)
Arancel: $80
Programa
Contenidos teóricos y metodológicos
Introducción general
Tipos de datos de biodiversidad: Taxonómicos, geográficos, ambientales, cronológicos, anatómicos, desarrollo, parentescos. Origen de datos de biodiversidad: Colecciones biológicas, observaciones, multimedia. Datos y metadatos. Especificaciones utilizadas en biodiversidad y disciplinas relacionadas.
Introducción a las bases de datos
Concepto de normalización e integridad eferencial. El modelo entidad-relación. Bases relacionales vs. bases orientadas a objetos, estado del arte. Las bases de datos heterogéneas distribuidas, su aplicación a la biodiversidad. Repositorios de datos.
Introducción a los metadatos
Datos y metadatos. Especificaciones utilizadas en biodiversidad y disciplinas relacionadas. Darwin Core: Versiones e implementaciones.
Metadatos de conjuntos de datos
Catálogos de metadatos de recursos de biodiversidad.
Metadatos de ubicación geoespacial
Método punto-radio. Protocolos de georreferenciación.
Metadatos de imágenes biológicas
Metadatos embebidos. Vistas estandarizadas. Repositorios. Digitalización de ejemplares mediante imágenes.
Datos taxonómicos
Catálogos de autoridad taxonómica. Agregadores de datos taxonómicos. Estimas de diversidad con taxonomía incompleta.
Identificadores únicos
Importancia y problemas de identificadores únicos. URIs, LSIDs.
Ontologías biológicas
Conceptos, relaciones y razonamientos automáticos. Web semántica, repositorios RDF.
Anotaciones utilizando ontologías.
Herramientas de adquisición de datos de colecciones biológicas
Funciones y problemática general. Modelos de datos usuales.
Proveedores de datos
Función y tecnología empleada. Proveedores TAPIR, IPT
Portales de datos
Función y tecnología empleada. Portales de iniciativas de biodiversidad.
Aplicaciones de datos de biodiversidad
Cybertaxonomía. Identificación taxonómica automática: DNA Barcodes y sistemas basados en imágenes. Modelado de distribuciones predictivas. Áreas de endemismo.
Inventarios y estimas de riqueza.
Trabajos prácticos
Búsquedas y procesamiento de datos de portales: GBIF, SNDB, BOLD, Morphbank.
Consultas en bases de datos relacionales.
Mapeo de campos de colecciones biológicas a Darwin Core.
Validación de colecciones de datos. Problemas
generales, métodos manuales y automáticos.
Georreferenciación de localidades geográficas.
Uso de servicios web.
Martin J. Ramirez
Profesor Adjunto UBA FCEyN EGE
Curador General & División Aracnología
Museo Argentino de Ciencias Naturales - CONICET
Av. Angel Gallardo 470
C1405DJR Buenos Aires
Argentina
tel +54 11 4982-8370 int. 169
fax +54 11 4982-6670 int. 172
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